164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1001 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 471 aa  945    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  57.68 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  54.39 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  52.41 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  54.7 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.95 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  51.53 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  45.37 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  41.01 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.6 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 479 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 475 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  41.43 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 		 479 aa  329  6e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.77 
 
 		 483 aa  329  6e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 		 479 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 		 482 aa  325  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  43.53 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  38.48 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  38.98 
 
 		 477 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  38.19 
 
 		 477 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  42.42 
 
 		 468 aa  319  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  37.87 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  40.4 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  37.91 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  40.43 
 
 		 467 aa  299  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  34.07 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 461 aa  276  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  28.76 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  28.76 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  28.76 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  28.76 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  28.54 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  28.54 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  27.88 
 
 		 445 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  31.37 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  28.32 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 394 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.91 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  33.62 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1514  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 536 aa  124  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  29.16 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1577  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  30.79 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2210  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 550 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  27.98 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  29.96 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  28.24 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  30.67 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  29.54 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 538 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  27.79 
 
 		 537 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 537 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 528 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  27.62 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 535 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  30.08 
 
 		 558 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  26.28 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  30.04 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  30.25 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  30.96 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.89 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1480  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 537 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 540 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1130  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 526 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 540 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.45 
 
 		 540 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  28.43 
 
 		 551 aa  96.7  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2911  hypothetical protein  28.11 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>