162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1221 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  100 
 
 
469 aa  952    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  78.11 
 
 
468 aa  782    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  62.8 
 
 
479 aa  614  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  62.15 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  61.85 
 
 
484 aa  610  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  61.03 
 
 
472 aa  592  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.59 
 
 
483 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  51.5 
 
 
483 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.25 
 
 
483 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  48.59 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  49.78 
 
 
454 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  41.94 
 
 
463 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 
463 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  41.68 
 
 
461 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 
464 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 
466 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 
462 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
460 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 
462 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
458 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
464 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 
460 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 
466 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.96 
 
 
469 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 
460 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  40.21 
 
 
477 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 
471 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  40.13 
 
 
475 aa  323  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  37.77 
 
 
468 aa  319  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  38.23 
 
 
457 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
479 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  37.2 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  38.46 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  38.14 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  36.4 
 
 
480 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
426 aa  206  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  29.25 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  29.25 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  29.25 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  27.77 
 
 
445 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  29.03 
 
 
445 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  27.77 
 
 
445 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  28.82 
 
 
445 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  29.03 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
445 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.63 
 
 
447 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  29.96 
 
 
447 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.93 
 
 
433 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  29.96 
 
 
455 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.83 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
512 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
556 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
527 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  23.14 
 
 
548 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
527 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  25.56 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
528 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  22.62 
 
 
546 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.43 
 
 
528 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  25.41 
 
 
533 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
533 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.4 
 
 
534 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
520 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  25.37 
 
 
537 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
540 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  25.62 
 
 
732 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
522 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
540 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
540 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
540 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.1 
 
 
540 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  24.74 
 
 
540 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
526 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  24.49 
 
 
558 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 
540 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
532 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.23 
 
 
532 aa  83.2  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  23.98 
 
 
447 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  23.97 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
542 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  25.36 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.23 
 
 
518 aa  77.8  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.02 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>