155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1879 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  63.47 
 
 
475 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  71.4 
 
 
477 aa  719    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  73.68 
 
 
477 aa  737    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  76 
 
 
477 aa  763    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  68.55 
 
 
480 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
479 aa  989    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  93.72 
 
 
479 aa  935    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  50.63 
 
 
460 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  48.11 
 
 
466 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
466 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
462 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  46.95 
 
 
464 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.65 
 
 
469 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 
458 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
460 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  43.38 
 
 
457 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 
460 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
469 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  41.49 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  39.5 
 
 
467 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
471 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
467 aa  325  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 
472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
479 aa  312  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  38.35 
 
 
469 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
483 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
463 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.94 
 
 
483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  36.06 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 
483 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
461 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
479 aa  299  8e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  34.74 
 
 
479 aa  299  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
462 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 
484 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
468 aa  292  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
445 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  30.84 
 
 
445 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  30.84 
 
 
445 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  30.19 
 
 
445 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  30.84 
 
 
445 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  30.28 
 
 
445 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  30.62 
 
 
445 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  30.62 
 
 
445 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  30.13 
 
 
445 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.9 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
394 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
426 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  36.66 
 
 
447 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  36.66 
 
 
447 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.85 
 
 
455 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.8 
 
 
270 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  25.73 
 
 
447 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  25.35 
 
 
548 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  26.04 
 
 
732 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  26.47 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
527 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
525 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
527 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  26.2 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  24.55 
 
 
553 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
556 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  24.3 
 
 
540 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
556 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  24.95 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
538 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  23.63 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  23.52 
 
 
578 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
534 aa  73.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
540 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.5 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 
577 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 
546 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  28.09 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  23.91 
 
 
534 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  23.19 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
570 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
536 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
513 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.9 
 
 
540 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>