155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  79.74 
 
 		 467 aa  763    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  70.26 
 
 		 467 aa  671    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  964    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  69.02 
 
 		 469 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  49.13 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  47.68 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  46.85 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  45.27 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.3 
 
 		 469 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  39.62 
 
 		 480 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  40.39 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  41.29 
 
 		 477 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  39.5 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  38.67 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  37.94 
 
 		 479 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  37.77 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  38.33 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.9 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  34.93 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.13 
 
 		 483 aa  299  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 463 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 462 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  28.91 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  29.57 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  29.57 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  29.57 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  29.13 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  29.13 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  29.19 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  28.32 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.47 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  32.69 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  32.62 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.34 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  26.73 
 
 		 548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.58 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  25.38 
 
 		 270 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23.26 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 532 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 519 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 546 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  25.84 
 
 		 528 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 522 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 543 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  24.79 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  25.31 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.27 
 
 		 534 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.43 
 
 		 532 aa  87  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 513 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 537 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  23.4 
 
 		 732 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  25.12 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  24.71 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  25.43 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  25.26 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  26.68 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  26.51 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 527 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  23.67 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>