56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2668 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  25.66 
 
 		 477 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  25.1 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  24.59 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  22.52 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  24.68 
 
 		 732 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  24.79 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  23.35 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  23.58 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  23.58 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  23.58 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  22.89 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  23.98 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  22.48 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.21 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  23.64 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  22.78 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  24.79 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  22.32 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  22.54 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  22.01 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  22.22 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  21.95 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.33 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  21.96 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  21.84 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  23.32 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5767  Putative FAD-dependent dehydrogenase-like protein  25.99 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>