168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1411 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
454 aa  923    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  65.57 
 
 
479 aa  615  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.14 
 
 
483 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 
483 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.03 
 
 
483 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 
479 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  49.78 
 
 
469 aa  441  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 
482 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  51.97 
 
 
484 aa  444  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 
468 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
472 aa  429  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 
464 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  44.37 
 
 
463 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  44.35 
 
 
460 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 
462 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 
458 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 
466 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
462 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
460 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
464 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 
462 aa  345  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 
460 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  39.29 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  40.4 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  37.67 
 
 
467 aa  310  4e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
469 aa  306  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.85 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
466 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
479 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  38.07 
 
 
457 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  34.11 
 
 
477 aa  289  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
479 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  34.32 
 
 
477 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.03 
 
 
480 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  35.38 
 
 
477 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
426 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  25.83 
 
 
445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
445 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  26.05 
 
 
445 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  26.05 
 
 
445 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  26.05 
 
 
445 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  26.71 
 
 
445 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  25.83 
 
 
445 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  25.77 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.9 
 
 
433 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.49 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  29.7 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  28.3 
 
 
455 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
522 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  25.58 
 
 
548 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  26.51 
 
 
534 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  26.46 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 
732 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.15 
 
 
535 aa  104  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
530 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
530 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
520 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  26.62 
 
 
270 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  25.33 
 
 
447 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
530 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  23.89 
 
 
518 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
528 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
533 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
535 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
527 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
527 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
512 aa  97.8  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
543 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
535 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
531 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
526 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
546 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  28.11 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
565 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
536 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
535 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23.03 
 
 
546 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
532 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  26.24 
 
 
556 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  25.8 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
535 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
524 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.58 
 
 
538 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
578 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  25.21 
 
 
539 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  24.03 
 
 
537 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
537 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  25.84 
 
 
538 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>