163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1600 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  94.62 
 
 		 483 aa  946    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.79 
 
 		 483 aa  932    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  993    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  56.48 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  56.14 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  52.19 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  50.97 
 
 		 484 aa  488  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  52.59 
 
 		 469 aa  481  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  50.98 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  50.54 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  44.16 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  44.37 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 464 aa  359  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 458 aa  356  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  40.39 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.27 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 475 aa  328  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 462 aa  325  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  36.04 
 
 		 477 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  36.19 
 
 		 477 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  39.08 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  34.9 
 
 		 468 aa  307  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  35.16 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  33.82 
 
 		 480 aa  299  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 469 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  33.19 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 426 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  29.32 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  28 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  28.38 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  28.16 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  28.16 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  28.16 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  28.38 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  27.72 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.85 
 
 		 433 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  32.6 
 
 		 447 aa  144  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  32.7 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.92 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.15 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  23.51 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.05 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  23.57 
 
 		 732 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 527 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 524 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  23.47 
 
 		 535 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 532 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  23.41 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.09 
 
 		 528 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 522 aa  87.4  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.01 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  23.82 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  25.26 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  24.41 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  22 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  22.71 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  23.74 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  22.96 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  23.96 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  21.26 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  23.97 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  22.93 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  23.62 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>