95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0135 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
394 aa  813    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  74.68 
 
 
426 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  36.63 
 
 
479 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
483 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.33 
 
 
483 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  32.99 
 
 
469 aa  200  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.71 
 
 
483 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
461 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
475 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
454 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
479 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
472 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
462 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 
479 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
479 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
464 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  32.86 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
482 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
479 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
484 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  31.06 
 
 
463 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
466 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
468 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
460 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  32.39 
 
 
477 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  32.11 
 
 
480 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  31.52 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
460 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
462 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.73 
 
 
469 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
466 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
471 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
460 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
467 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
462 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  31.75 
 
 
468 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  31.64 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  29.26 
 
 
457 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
469 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.68 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.6 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  29.43 
 
 
455 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  29.14 
 
 
447 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  22.75 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  22.03 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  22.89 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  21.27 
 
 
445 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  21.27 
 
 
445 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  21.27 
 
 
445 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  21.01 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  21.01 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  25.56 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  25.16 
 
 
447 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.86 
 
 
528 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  22.67 
 
 
546 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
533 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  26.86 
 
 
610 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  24.65 
 
 
540 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
540 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  24.29 
 
 
732 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
540 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
540 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
540 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
565 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.3 
 
 
540 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  21.75 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
539 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.19 
 
 
535 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  26.67 
 
 
556 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
540 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  20.44 
 
 
548 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  23.05 
 
 
527 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 
522 aa  46.6  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
535 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  24.11 
 
 
538 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
535 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  24.06 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  32.04 
 
 
553 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
537 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  24.31 
 
 
519 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
528 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
537 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  26.59 
 
 
537 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
526 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
556 aa  43.1  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  37.97 
 
 
436 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
532 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>