156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2408 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  70.76 
 
 		 477 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 479 aa  989    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  93.72 
 
 		 479 aa  935    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  67.3 
 
 		 480 aa  682    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  63.67 
 
 		 475 aa  651    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  73.47 
 
 		 477 aa  731    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  75.37 
 
 		 477 aa  754    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 		 460 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  47.81 
 
 		 466 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.61 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  43.07 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  42.52 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  41.31 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  39.42 
 
 		 467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 		 471 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  38.43 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 464 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  35.56 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.24 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 479 aa  293  6e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  34.53 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  29.85 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  29.98 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  30.62 
 
 		 445 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  30.62 
 
 		 445 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  30.62 
 
 		 445 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  30.62 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  30.41 
 
 		 445 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  29.76 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.74 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  34.62 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  34.38 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.5 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.42 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  25.4 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  24.9 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  26.75 
 
 		 732 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 525 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  25.88 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  25.22 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  24.75 
 
 		 553 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  25.15 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  24 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  23.9 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  23.9 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  24.3 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  22.13 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  25.71 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  25 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>