160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0535 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
483 aa  992    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  92.55 
 
 
483 aa  922    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  94.62 
 
 
483 aa  946    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  55.6 
 
 
479 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 
454 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  51.7 
 
 
479 aa  490  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
484 aa  491  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  51.5 
 
 
469 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  44.73 
 
 
463 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  45.77 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  45.3 
 
 
463 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  45.3 
 
 
461 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 
466 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
462 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
462 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 
460 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 
460 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 
460 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 
464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
458 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.48 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
466 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
471 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
462 aa  326  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  37.5 
 
 
477 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  37.79 
 
 
477 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
479 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  39.74 
 
 
457 aa  307  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
467 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  35.78 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.21 
 
 
477 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.45 
 
 
480 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
469 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  33.55 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
426 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
394 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  29.2 
 
 
445 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  29.42 
 
 
445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
445 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  28.76 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.2 
 
 
433 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.12 
 
 
447 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  30.84 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.7 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  24.69 
 
 
548 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  29.77 
 
 
270 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 
530 aa  103  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
513 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 
527 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.63 
 
 
534 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
512 aa  97.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
527 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  23.32 
 
 
535 aa  90.9  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  22.32 
 
 
732 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
522 aa  90.1  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  23.93 
 
 
528 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
520 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 
540 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.71 
 
 
540 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  23.22 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 
540 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  24 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.02 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 
524 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  22.22 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  22.78 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  23.72 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  23.45 
 
 
551 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 
546 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  22.88 
 
 
537 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
536 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 
519 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  24.64 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
538 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  22.71 
 
 
537 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  22.41 
 
 
537 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>