162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0312 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  92.55 
 
 
483 aa  922    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
483 aa  991    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.79 
 
 
483 aa  932    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  55.6 
 
 
479 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  54.03 
 
 
454 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  51.3 
 
 
479 aa  484  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  52.25 
 
 
469 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 
479 aa  481  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 
484 aa  480  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
482 aa  479  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  50.76 
 
 
472 aa  478  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 
463 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  44.21 
 
 
463 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
461 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 
466 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
462 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
460 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 
460 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 
462 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
464 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 
460 aa  349  8e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
458 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.38 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
471 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
462 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 
466 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  36.88 
 
 
477 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  36.61 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  38.65 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
479 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
467 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  35.13 
 
 
468 aa  299  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.21 
 
 
477 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.45 
 
 
480 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
479 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  33.63 
 
 
467 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
469 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
426 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
394 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  28.67 
 
 
445 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  28.67 
 
 
445 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  28.82 
 
 
445 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  28.6 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  28.6 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  28.6 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
445 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  28.16 
 
 
445 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  32.13 
 
 
433 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.43 
 
 
447 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  31.43 
 
 
447 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.21 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 
548 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.15 
 
 
270 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 
530 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  23.69 
 
 
732 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
512 aa  98.2  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 
513 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.74 
 
 
534 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 
527 aa  94  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 
527 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.31 
 
 
528 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
522 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
532 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  23.97 
 
 
558 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  22.76 
 
 
530 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  21.21 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.84 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.31 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 
556 aa  77.8  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  22.83 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
519 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  25.15 
 
 
519 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  23.29 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  23.63 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 
546 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  23.34 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  22.46 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  22.61 
 
 
537 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  20.97 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  21.21 
 
 
558 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>