156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2105 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  66.42 
 
 
535 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1130  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.86 
 
 
537 aa  720    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0718061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2911  hypothetical protein  63.28 
 
 
561 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  66.92 
 
 
537 aa  715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  67.47 
 
 
558 aa  690    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  67.29 
 
 
537 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  64.13 
 
 
538 aa  701    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  70.45 
 
 
546 aa  762    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2459  FAD dependent oxidoreductase  83.64 
 
 
538 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  70.9 
 
 
553 aa  746    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  68.48 
 
 
537 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  95.74 
 
 
540 aa  1041    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  68.12 
 
 
546 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  68.04 
 
 
539 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  64.88 
 
 
539 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3461  FAD dependent oxidoreductase  61.49 
 
 
590 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  66.91 
 
 
543 aa  715    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  91.48 
 
 
540 aa  996    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2210  FAD dependent oxidoreductase  62.36 
 
 
550 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  63.57 
 
 
538 aa  698    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  83.83 
 
 
539 aa  903    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  99.26 
 
 
540 aa  1095    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  68.04 
 
 
537 aa  722    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1577  FAD dependent oxidoreductase  62.31 
 
 
539 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  93.7 
 
 
540 aa  1020    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  99.26 
 
 
540 aa  1095    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  60.82 
 
 
536 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  61.36 
 
 
577 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  66.91 
 
 
578 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3727  FAD dependent oxidoreductase  61.17 
 
 
593 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621877  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0507  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 
598 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  68 
 
 
556 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3010  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 
593 aa  651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  64.75 
 
 
537 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  68.48 
 
 
537 aa  719    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  66.48 
 
 
538 aa  719    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 
534 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1514  FAD dependent oxidoreductase  61.94 
 
 
536 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4405  FAD dependent oxidoreductase  71.03 
 
 
532 aa  731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556143  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  66.23 
 
 
543 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1480  FAD dependent oxidoreductase  64.8 
 
 
537 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.439107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.89 
 
 
540 aa  1019    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  68.48 
 
 
539 aa  728    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  65.05 
 
 
539 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1419  FAD dependent oxidoreductase  59.48 
 
 
594 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  91.11 
 
 
540 aa  994    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  66.29 
 
 
535 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1180  FAD dependent oxidoreductase  67.61 
 
 
541 aa  699    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 
535 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  65.23 
 
 
535 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
540 aa  1101    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  65.55 
 
 
565 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  59.09 
 
 
558 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  56.73 
 
 
551 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  54.95 
 
 
558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  51.21 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  53.38 
 
 
532 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  51.98 
 
 
556 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  45.88 
 
 
528 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  49.25 
 
 
528 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  44.77 
 
 
548 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  44.67 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  43.98 
 
 
546 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  47.29 
 
 
533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2344  hypothetical protein  47.1 
 
 
533 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  48.43 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 
556 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
527 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  46.8 
 
 
533 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 
524 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  47.64 
 
 
553 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  45.27 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  47.07 
 
 
537 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 
526 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 
570 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  46.42 
 
 
532 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  46.83 
 
 
533 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  49.01 
 
 
610 aa  398  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  42.54 
 
 
534 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 
520 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 
530 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 
530 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  41.47 
 
 
534 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
525 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  40.63 
 
 
518 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 
522 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
513 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 
530 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 
519 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
531 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
536 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  38.91 
 
 
512 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
542 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  42.6 
 
 
515 aa  335  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 
530 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  43.01 
 
 
463 aa  326  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  43.25 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  41.01 
 
 
472 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
462 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>