159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7300 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
520 aa  1073    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  60.39 
 
 
513 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  58.06 
 
 
525 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  57.23 
 
 
519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  55.6 
 
 
518 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  55.24 
 
 
542 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  53.13 
 
 
534 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  51.95 
 
 
522 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  53.53 
 
 
515 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  47.95 
 
 
530 aa  487  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  49.81 
 
 
519 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  47.2 
 
 
546 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
527 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 
543 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  42.16 
 
 
535 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 
578 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  40.66 
 
 
528 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 
533 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  38.18 
 
 
546 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 
530 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 
524 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
530 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
530 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 
531 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
546 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 
539 aa  365  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
539 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  41.14 
 
 
577 aa  364  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3461  FAD dependent oxidoreductase  40.21 
 
 
590 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  42.91 
 
 
535 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
532 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 
535 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  43.81 
 
 
537 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  43.81 
 
 
537 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
543 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 
540 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
528 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 
537 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4405  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 
532 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556143  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  41.05 
 
 
540 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  39.49 
 
 
532 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3727  FAD dependent oxidoreductase  41.02 
 
 
593 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621877  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 
540 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  42.04 
 
 
553 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3010  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
593 aa  353  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  42.88 
 
 
534 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
540 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 
540 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1480  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 
537 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.439107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  41.1 
 
 
565 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.49 
 
 
540 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  40.24 
 
 
539 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 
537 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1130  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.56 
 
 
537 aa  348  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0718061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
526 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1419  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
594 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2459  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
538 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  41.05 
 
 
537 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
537 aa  342  9e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  41.09 
 
 
539 aa  341  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  40.77 
 
 
556 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  41.37 
 
 
533 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2911  hypothetical protein  41.9 
 
 
561 aa  339  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
536 aa  339  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  38.45 
 
 
610 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  40.36 
 
 
553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1180  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 
534 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  38.36 
 
 
538 aa  333  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 
558 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  41.99 
 
 
558 aa  332  9e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  38.95 
 
 
538 aa  332  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  38.75 
 
 
539 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
538 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1514  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 
536 aa  329  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  43.53 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 
532 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1577  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
539 aa  326  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2210  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
550 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
570 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  37.34 
 
 
548 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 
512 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  37.76 
 
 
530 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0507  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
598 aa  319  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  39.52 
 
 
551 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 
556 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 
556 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  38.69 
 
 
558 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  38.68 
 
 
533 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2344  hypothetical protein  38.61 
 
 
533 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  41.26 
 
 
472 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
460 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>