166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0865 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  75.11 
 
 
464 aa  716    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  71.37 
 
 
463 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  945    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  70.7 
 
 
462 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  72.03 
 
 
463 aa  685    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  44.49 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  45.3 
 
 
483 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.88 
 
 
483 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.84 
 
 
483 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 
454 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
479 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
468 aa  385  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  41.68 
 
 
469 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 
482 aa  382  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  43.42 
 
 
484 aa  378  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
479 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
472 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
466 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
462 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.52 
 
 
469 aa  316  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
458 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
464 aa  309  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.21 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  36.17 
 
 
480 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
460 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
479 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  35.54 
 
 
468 aa  297  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  36.27 
 
 
477 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
479 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
466 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  35.37 
 
 
477 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  35.65 
 
 
457 aa  289  7e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  34.35 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
471 aa  276  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
426 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.77 
 
 
433 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  31.05 
 
 
447 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.84 
 
 
447 aa  153  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
445 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  25.11 
 
 
445 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  25.11 
 
 
445 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  26.15 
 
 
445 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  26.92 
 
 
455 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  26.15 
 
 
445 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  26.15 
 
 
445 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  26.15 
 
 
445 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  25.93 
 
 
445 aa  146  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  26.37 
 
 
445 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  26.22 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
513 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  27.58 
 
 
528 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  26.96 
 
 
732 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
530 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  26 
 
 
534 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  28.73 
 
 
270 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
525 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
522 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
527 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
527 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
556 aa  99.8  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  26.14 
 
 
518 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
519 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  26.85 
 
 
537 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
542 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
537 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  28.04 
 
 
463 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
532 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  27.24 
 
 
553 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
530 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
530 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
533 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
526 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  25.74 
 
 
515 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
536 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
524 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  24.9 
 
 
610 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.47 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.06 
 
 
556 aa  83.2  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  25.48 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  27.46 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  26.97 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.37 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  23.82 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>