175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2634 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  71.74 
 
 
464 aa  712    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  84.02 
 
 
463 aa  830    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  72.03 
 
 
461 aa  685    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  87.12 
 
 
462 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
463 aa  956    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  43.89 
 
 
479 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  44.73 
 
 
483 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.97 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.23 
 
 
483 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
472 aa  389  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  41.47 
 
 
469 aa  382  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
454 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
479 aa  383  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 
468 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  43.29 
 
 
482 aa  378  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 
479 aa  375  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 
484 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 
460 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 
466 aa  353  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
462 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.13 
 
 
469 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 
460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 
475 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 
464 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
460 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
466 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
479 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  35.71 
 
 
477 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 
469 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  33.98 
 
 
467 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  34.86 
 
 
477 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  35.15 
 
 
477 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
467 aa  296  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  35.14 
 
 
480 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  34.88 
 
 
468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  34.57 
 
 
457 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
471 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
426 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
394 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
445 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.11 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  25.83 
 
 
445 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  25.17 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  25.17 
 
 
445 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.45 
 
 
447 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  31.75 
 
 
447 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.18 
 
 
455 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  27.29 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
530 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  25.79 
 
 
528 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
527 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
528 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.02 
 
 
518 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
522 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  29.52 
 
 
463 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
520 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  28.51 
 
 
270 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
556 aa  99  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.26 
 
 
546 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
535 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  26.92 
 
 
519 aa  98.2  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.48 
 
 
534 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.38 
 
 
535 aa  97.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  28.33 
 
 
530 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  25.57 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
570 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
532 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
533 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  28.96 
 
 
533 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  25.8 
 
 
515 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  25.78 
 
 
610 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
526 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
530 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  26.05 
 
 
533 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  26 
 
 
539 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
525 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
540 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  26.71 
 
 
553 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  26.6 
 
 
539 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2344  hypothetical protein  25.84 
 
 
533 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  25.41 
 
 
540 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.84 
 
 
532 aa  87.8  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
543 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>