149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2676 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  72.98 
 
 		 533 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 533 aa  1073    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  63.58 
 
 		 527 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  62.9 
 
 		 527 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  66.4 
 
 		 537 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  59.77 
 
 		 532 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  59.32 
 
 		 524 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  55.66 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  46.79 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  51.57 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  47.65 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  47.2 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2344  hypothetical protein  47.47 
 
 		 533 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  45.37 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  44.59 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  46.95 
 
 		 546 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 536 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1514  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 		 536 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  47.41 
 
 		 546 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  46.05 
 
 		 538 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2210  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1577  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  45.24 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4405  FAD dependent oxidoreductase  48.19 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  44.95 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  50.29 
 
 		 558 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  48.48 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  44.82 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  46.64 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 535 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1180  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  46.4 
 
 		 530 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  45.62 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  46.99 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  46.99 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 578 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  44.57 
 
 		 537 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  43.73 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  46.8 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  46.26 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  45.95 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  45.95 
 
 		 539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  46.69 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  43.76 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3010  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 593 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1130  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.53 
 
 		 537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  47.31 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  45.34 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  46.96 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  46.75 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3727  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 		 593 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.75 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  46.54 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  43.02 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 531 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1480  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 537 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1419  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  44.13 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2911  hypothetical protein  42.88 
 
 		 561 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  42.68 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2459  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3461  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  45.51 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  46.4 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  40.49 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0507  FAD dependent oxidoreductase  44.61 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  43.65 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  46.18 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.31 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 		 525 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  43.23 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 536 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 530 aa  334  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  40.93 
 
 		 519 aa  329  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  45.61 
 
 		 463 aa  316  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  44.58 
 
 		 472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>