159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0014 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  78.11 
 
 		 469 aa  782    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 468 aa  957    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 		 479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 		 479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  61.17 
 
 		 484 aa  599  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  60.68 
 
 		 472 aa  594  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.54 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 		 483 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  47.73 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  43.17 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  41.04 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 462 aa  362  8e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 460 aa  336  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  38.28 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 475 aa  309  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  36.17 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  37.01 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  37.12 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  35.28 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  36.8 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.77 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  27.79 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  27.79 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  27.79 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  27.79 
 
 		 445 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  26.91 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  27.35 
 
 		 445 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  26.7 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  26.74 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  32.83 
 
 		 433 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.63 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  33.04 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  28.69 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 512 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.4 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 527 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  24.64 
 
 		 548 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  29.39 
 
 		 270 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 528 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.52 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 533 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 522 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 525 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 540 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  24.01 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23.38 
 
 		 546 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  24.85 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.59 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  24.15 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  24.79 
 
 		 732 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  25.46 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  24.84 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  23.99 
 
 		 553 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  26.25 
 
 		 540 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 542 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  22.77 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  24.37 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  24.84 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  22.79 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  22.71 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2459  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 538 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  23.93 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>