159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2846 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  982    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  65.57 
 
 
454 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.48 
 
 
483 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  55.6 
 
 
483 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.6 
 
 
483 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 
479 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 
479 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  50.54 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  50.97 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  48.59 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 
468 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 
472 aa  429  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  43.89 
 
 
463 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  44.49 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  42.76 
 
 
463 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
464 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 
464 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
462 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 
462 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
466 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
462 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
460 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 
460 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
460 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.39 
 
 
469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 
467 aa  336  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  37.94 
 
 
468 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  36.93 
 
 
467 aa  316  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  35.08 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  39.12 
 
 
457 aa  312  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  36.21 
 
 
477 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.71 
 
 
477 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.94 
 
 
480 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
479 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
479 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
426 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 
394 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  27.21 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  26.99 
 
 
445 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  27.75 
 
 
445 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  27.75 
 
 
445 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  27.75 
 
 
445 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
445 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  27.53 
 
 
445 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  27.75 
 
 
445 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  27.59 
 
 
445 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.7 
 
 
433 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.37 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  29.63 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  29.34 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  25.2 
 
 
548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.58 
 
 
534 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
527 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
522 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
512 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
527 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
520 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
542 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
530 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  25.57 
 
 
528 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.22 
 
 
518 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
533 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 
519 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
532 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  26.87 
 
 
270 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  22.72 
 
 
535 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
525 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  25.15 
 
 
732 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23 
 
 
546 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
543 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
535 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
578 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  25.1 
 
 
530 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
540 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  23.83 
 
 
610 aa  90.1  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  25.79 
 
 
540 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  25.38 
 
 
515 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  25.39 
 
 
539 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  25 
 
 
538 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
535 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  24.95 
 
 
538 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  23.48 
 
 
539 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
565 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
535 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  24.53 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
543 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 
536 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>