157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0164 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  91.4 
 
 
482 aa  901    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  89.1 
 
 
479 aa  887    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  89.54 
 
 
484 aa  890    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
479 aa  970    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  62.8 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 
468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  63.12 
 
 
472 aa  591  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.19 
 
 
483 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.3 
 
 
483 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  50.43 
 
 
479 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 
454 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
461 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  43.13 
 
 
463 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  45.41 
 
 
466 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 
464 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
463 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
462 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
462 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 
464 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 
460 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
462 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
466 aa  343  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  41.77 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.91 
 
 
469 aa  326  7e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
475 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 
467 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
479 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  37.29 
 
 
477 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  36.68 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  37.8 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  36.61 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
469 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.71 
 
 
477 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  35.68 
 
 
480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
394 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
445 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  26.97 
 
 
445 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  26.27 
 
 
445 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  27.15 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  34.47 
 
 
447 aa  150  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  34.27 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  31.62 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  30.83 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  27.93 
 
 
455 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
512 aa  107  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  25.79 
 
 
528 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  26.34 
 
 
548 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
533 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  27.44 
 
 
537 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
556 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  27.94 
 
 
533 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
527 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
520 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.05 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
526 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  27.08 
 
 
732 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
530 aa  90.1  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  27.71 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  27.31 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
524 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
519 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
513 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23.26 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  25.4 
 
 
610 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.45 
 
 
532 aa  82.8  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  25.15 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 
546 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  23.65 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  24.59 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  23.13 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  25 
 
 
519 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
540 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  24.32 
 
 
551 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
540 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
540 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
535 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  25.64 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  23.45 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  25.53 
 
 
540 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>