103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8970 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 732 aa  1474    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 460 aa  124  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  26.6 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.57 
 
 		 483 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  24.64 
 
 		 477 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 479 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 466 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.2 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 454 aa  112  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 475 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  25.56 
 
 		 477 aa  111  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 463 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 467 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 479 aa  108  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  24.08 
 
 		 477 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 466 aa  107  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  23.8 
 
 		 463 aa  106  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  26.18 
 
 		 447 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  23.33 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 458 aa  104  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  23.4 
 
 		 468 aa  103  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  25.62 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  23.31 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  23.73 
 
 		 457 aa  101  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 460 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 464 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.64 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  30.11 
 
 		 455 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 462 aa  99  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 469 aa  99  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  24.2 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  24.03 
 
 		 445 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  24.3 
 
 		 445 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  24.3 
 
 		 445 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  24.3 
 
 		 445 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  24.3 
 
 		 445 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  24.03 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  23.98 
 
 		 445 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 426 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 445 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  24.12 
 
 		 548 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 394 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  22.42 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 528 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 546 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  22.13 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 577 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 535 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  25.67 
 
 		 551 aa  51.6  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 540 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 533 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  22.95 
 
 		 535 aa  50.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  22.06 
 
 		 447 aa  50.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.39 
 
 		 540 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  26.39 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 538 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 556 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 540 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.28 
 
 		 538 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  22.68 
 
 		 433 aa  49.3  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 540 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 524 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  21.19 
 
 		 536 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3727  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 593 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  22.76 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1419  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 594 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  25.89 
 
 		 463 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0507  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 598 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 537 aa  45.8  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  24.24 
 
 		 553 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  22.18 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  46.51 
 
 		 745 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.1 
 
 		 556 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 565 aa  45.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3010  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 593 aa  45.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 512 aa  45.4  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  22.64 
 
 		 528 aa  45.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 534 aa  44.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  21.85 
 
 		 513 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>