158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1514 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  65.61 
 
 		 535 aa  708    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2911  hypothetical protein  64.32 
 
 		 561 aa  693    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4114  hypothetical protein  63.74 
 
 		 537 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3661  FAD dependent oxidoreductase  62.87 
 
 		 540 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00457212  hitchhiker  0.000000525013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3851  hypothetical protein  63.18 
 
 		 537 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1135  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  68.83 
 
 		 538 aa  746    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0232041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 546 aa  712    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  62.85 
 
 		 553 aa  690    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  63.93 
 
 		 537 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5392  FAD dependent oxidoreductase  61.57 
 
 		 540 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1991  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.64 
 
 		 540 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  64.18 
 
 		 539 aa  697    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1049  FAD dependent oxidoreductase  61.07 
 
 		 543 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553472  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0296  hypothetical protein  63.06 
 
 		 540 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2210  FAD dependent oxidoreductase  87.08 
 
 		 550 aa  956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1286  FAD dependent oxidoreductase  69.57 
 
 		 538 aa  753    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  60.22 
 
 		 539 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5991  FAD dependent oxidoreductase  61.75 
 
 		 540 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  68.03 
 
 		 537 aa  738    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1577  FAD dependent oxidoreductase  87.27 
 
 		 539 aa  959    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2121  FAD dependent oxidoreductase  61.45 
 
 		 540 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2086  FAD dependent oxidoreductase  61.75 
 
 		 540 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0605  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 558 aa  636    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731082  normal  0.0347159 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2795  FAD dependent oxidoreductase  81.8 
 
 		 536 aa  898    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4301  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 577 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.263037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3446  FAD dependent oxidoreductase  59.21 
 
 		 578 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3727  FAD dependent oxidoreductase  56.75 
 
 		 593 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1437  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  60.47 
 
 		 556 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  60.52 
 
 		 546 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  62.38 
 
 		 537 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1450  FAD dependent oxidoreductase  63.75 
 
 		 537 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.568494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  68.91 
 
 		 538 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0945  FAD dependent oxidoreductase  62.13 
 
 		 534 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4405  FAD dependent oxidoreductase  61.35 
 
 		 532 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  65.42 
 
 		 543 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1480  FAD dependent oxidoreductase  69.35 
 
 		 537 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  71.4 
 
 		 539 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3266  putative uncharacterized dehydrogenase  67.16 
 
 		 539 aa  763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.346761  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1419  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 594 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  65.61 
 
 		 535 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1180  FAD dependent oxidoreductase  61.06 
 
 		 541 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1514  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 536 aa  1109    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  65.42 
 
 		 535 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  66.04 
 
 		 535 aa  759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2105  FAD dependent oxidoreductase  61.94 
 
 		 540 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323852  normal  0.276604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3847  FAD dependent oxidoreductase  59.82 
 
 		 565 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1130  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.64 
 
 		 537 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3461  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3010  FAD dependent oxidoreductase  56.75 
 
 		 593 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2459  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 		 538 aa  628  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  57.67 
 
 		 539 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0507  FAD dependent oxidoreductase  53.24 
 
 		 598 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1640  hypothetical protein  54.61 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  54.87 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0722  hypothetical protein  53.99 
 
 		 558 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.564475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  50.56 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  51.13 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  51.04 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  48.77 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  45.65 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  45.22 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  42.78 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  45.78 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  47.24 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  43.38 
 
 		 532 aa  445  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  45.2 
 
 		 524 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  46.28 
 
 		 553 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  45.2 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2344  hypothetical protein  45.2 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  43.46 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1121  hypothetical protein  42.72 
 
 		 533 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  41.05 
 
 		 610 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  44.64 
 
 		 537 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  41.75 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 520 aa  352  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  37.48 
 
 		 518 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2284  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.426468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1528  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 530 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3358  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 530 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 530 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  41.69 
 
 		 534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  42.15 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 530 aa  316  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  39.8 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  39.7 
 
 		 463 aa  290  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33225  predicted protein  38.59 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524804  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>