114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1462 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  93.87 
 
 
309 aa  567  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  89.68 
 
 
307 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  81.94 
 
 
308 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  73.87 
 
 
309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.25 
 
 
272 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.62 
 
 
260 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.77 
 
 
268 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.88 
 
 
286 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  37.32 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.43 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.17 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.65 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.86 
 
 
258 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.54 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.91 
 
 
263 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.43 
 
 
261 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.25 
 
 
271 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.37 
 
 
275 aa  155  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.84 
 
 
259 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.41 
 
 
255 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  36 
 
 
264 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.93 
 
 
254 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.78 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.56 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  32.97 
 
 
254 aa  146  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.07 
 
 
261 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.59 
 
 
263 aa  142  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.73 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  30.87 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.37 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.45 
 
 
256 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.23 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.23 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.23 
 
 
261 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.29 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.91 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  39.34 
 
 
427 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  57.89 
 
 
508 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  46.58 
 
 
558 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  48.84 
 
 
463 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  56.76 
 
 
505 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  48.78 
 
 
462 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 
499 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4935  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.08 
 
 
605 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  59.52 
 
 
503 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.94 
 
 
430 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  23.85 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  44.9 
 
 
431 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  59.46 
 
 
503 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  33.33 
 
 
670 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  33.33 
 
 
670 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  35.06 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  54.05 
 
 
522 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1447  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 
1012 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
542 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 
449 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  54.05 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.17 
 
 
573 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  40.98 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.22 
 
 
776 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.17 
 
 
573 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1545  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0160439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  48.57 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.43 
 
 
687 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  51.28 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  35.9 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
430 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  52.63 
 
 
997 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  35.38 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  61.76 
 
 
506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.68 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  61.76 
 
 
506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 
528 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.62 
 
 
647 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
490 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  61.76 
 
 
506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0638  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.5 
 
 
414 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
438 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  54.05 
 
 
525 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  29.27 
 
 
448 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1884  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.28 
 
 
419 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.254068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60 
 
 
413 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0158995  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4482  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.18 
 
 
490 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.38 
 
 
1012 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1647  heterodisulfide reductase, subunit A  40.32 
 
 
752 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0109393  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  45 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  45.45 
 
 
479 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.37 
 
 
352 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.175928  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  38.16 
 
 
635 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  36.84 
 
 
557 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  47.5 
 
 
435 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.33 
 
 
420 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 
513 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  48.72 
 
 
464 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
487 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>