279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4861 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  100 
 
 		 454 aa  933    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  51.11 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  33.84 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.98 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 457 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.68 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.24 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.04 
 
 		 432 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  35.82 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  32.81 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  28.28 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  32.58 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.4 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 457 aa  143  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.07 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  30.71 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.53 
 
 		 600 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.28 
 
 		 672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.08 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  25.39 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  29.85 
 
 		 624 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  28.17 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  27.63 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.6 
 
 		 606 aa  113  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  25.97 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  27.58 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  22.55 
 
 		 618 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.94 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.65 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  26.85 
 
 		 797 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.46 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.89 
 
 		 764 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  24.27 
 
 		 757 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.75 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  22.72 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  23.62 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.82 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  23.22 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  23.22 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.92 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.6 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  30.87 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  30.34 
 
 		 531 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  24.62 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.3 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.89 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.1 
 
 		 556 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  30.19 
 
 		 599 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  33.05 
 
 		 764 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  55.1 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  30.41 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  34.51 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.5 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  31.08 
 
 		 530 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  24 
 
 		 543 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.82 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  19.75 
 
 		 625 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.91 
 
 		 594 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.21 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>