227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1555 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  89.66 
 
 
275 aa  455  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  86.97 
 
 
273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  85.44 
 
 
259 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  61.9 
 
 
263 aa  318  7e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  59.36 
 
 
267 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.17 
 
 
271 aa  281  9e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  48.63 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.8 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.81 
 
 
286 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.66 
 
 
258 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.24 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.69 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.85 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.12 
 
 
259 aa  204  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.45 
 
 
271 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.82 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.27 
 
 
254 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.78 
 
 
254 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  45.14 
 
 
254 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.06 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 
262 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 
261 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.47 
 
 
256 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.08 
 
 
255 aa  174  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.58 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.18 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.3 
 
 
307 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.92 
 
 
272 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  38.43 
 
 
310 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.19 
 
 
309 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.34 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.19 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.09 
 
 
277 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.07 
 
 
309 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.14 
 
 
351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  28.63 
 
 
331 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.6 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.84 
 
 
914 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  45.61 
 
 
997 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.18 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  60.98 
 
 
469 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 
399 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  29.93 
 
 
420 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.68 
 
 
891 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  36.46 
 
 
487 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  37.66 
 
 
670 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
536 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 
409 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.86 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  37.21 
 
 
681 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.35 
 
 
654 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  48.98 
 
 
470 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.44 
 
 
492 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.86 
 
 
677 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  56.1 
 
 
529 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
895 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  43.4 
 
 
991 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.67 
 
 
448 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.47 
 
 
429 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  37.21 
 
 
681 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  26.54 
 
 
494 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
551 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.57 
 
 
681 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.5 
 
 
612 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.33 
 
 
544 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0094  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  37.08 
 
 
673 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  36.36 
 
 
670 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.89 
 
 
420 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  31.51 
 
 
484 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
429 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.08 
 
 
673 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
429 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.14 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3770  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 
387 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107297  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 
445 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  34.31 
 
 
580 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
431 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.14 
 
 
391 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.08 
 
 
673 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  46.43 
 
 
429 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  40.48 
 
 
689 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  39.13 
 
 
476 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  38.96 
 
 
597 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.23 
 
 
455 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.67 
 
 
467 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
419 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  54.76 
 
 
511 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.08 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 
387 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  51.43 
 
 
938 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  33.9 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>