More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1889 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  778    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  69.06 
 
 
374 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  69.06 
 
 
374 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  37.83 
 
 
378 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  34.05 
 
 
377 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  34.44 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  33.8 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  34.17 
 
 
377 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
393 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 
388 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33.9 
 
 
371 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
367 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  29.07 
 
 
388 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.97 
 
 
382 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.92 
 
 
390 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  28.06 
 
 
396 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  28.88 
 
 
382 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 
376 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
425 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  28.29 
 
 
388 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  29 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.02 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  29 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  29 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.93 
 
 
384 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  29.07 
 
 
392 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 
395 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 
397 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.33 
 
 
410 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  29.19 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.95 
 
 
378 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 
388 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4042  monooxygenase, FAD-binding  29.81 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.06 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.35 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  28.77 
 
 
377 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.91 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.61 
 
 
396 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.27 
 
 
385 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.24 
 
 
422 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.8 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.72 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.06 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3836  monooxygenase FAD-binding  26.47 
 
 
351 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  25.8 
 
 
391 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.67 
 
 
404 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 
362 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 
362 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2304  monooxygenase FAD-binding  24.48 
 
 
340 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  25.14 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  26.15 
 
 
393 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  26.34 
 
 
697 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  24.93 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 
407 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
378 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.33 
 
 
378 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  26.11 
 
 
362 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.93 
 
 
374 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.33 
 
 
399 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  24.23 
 
 
391 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 
386 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  30.26 
 
 
374 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 
385 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.26 
 
 
376 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 
373 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  24.8 
 
 
377 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  25 
 
 
360 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 
381 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.21 
 
 
376 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
364 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.32 
 
 
385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.32 
 
 
385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0392  monooxygenase FAD-binding protein  28.23 
 
 
383 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890611  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  23.35 
 
 
402 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  26.1 
 
 
374 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.23 
 
 
378 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4962  hypothetical protein  25.06 
 
 
408 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42035  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 
383 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  28.65 
 
 
400 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  26.03 
 
 
557 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  24.55 
 
 
373 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  24.51 
 
 
420 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.44 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>