More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3586 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 
427 aa  853    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  36.57 
 
 
448 aa  250  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07382  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01460)  37.32 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07902  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.4 
 
 
385 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 
378 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.82 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 
383 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.36 
 
 
404 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.32 
 
 
404 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  32.09 
 
 
382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  32.35 
 
 
382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.5 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 
382 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 
421 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.55 
 
 
422 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.82 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.55 
 
 
404 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
410 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.33 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.88 
 
 
404 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00530  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 
435 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.192511  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  31.3 
 
 
385 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  31.3 
 
 
385 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 
385 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
385 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.57 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.86 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 
385 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.84 
 
 
386 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
400 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.27 
 
 
402 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.17 
 
 
387 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 
385 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.16 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.09 
 
 
397 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.69 
 
 
405 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.09 
 
 
399 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03382  Putative uncharacterized proteinSalicylate 1-monooxygenase ;(EC 1.14.13.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ8]  27.35 
 
 
473 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.209179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.67 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03227  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  32.84 
 
 
373 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01033  hypothetical protein  30.05 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.10266 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  26.93 
 
 
435 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.06 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.3 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.03 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 
381 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.33 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.39 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  33.25 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 
412 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
395 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  29.74 
 
 
391 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.92 
 
 
402 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  29.74 
 
 
391 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.57 
 
 
400 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  32.39 
 
 
397 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.92 
 
 
447 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 
390 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  29.92 
 
 
402 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 
384 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  31.84 
 
 
401 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  28.28 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  28.61 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  28.33 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.06 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  22.9 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.62 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.26 
 
 
401 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  27.55 
 
 
400 aa  113  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.56 
 
 
378 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.66 
 
 
413 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08470  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347235  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  27.7 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  30.09 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  27.12 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.3 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 
425 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 
421 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.36 
 
 
414 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.63 
 
 
395 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.93 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  25.52 
 
 
459 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.93 
 
 
374 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
367 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
395 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.84 
 
 
421 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  30.13 
 
 
309 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  27.71 
 
 
710 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 
389 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  26.56 
 
 
397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.61 
 
 
420 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  30.37 
 
 
444 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  26.56 
 
 
397 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>