More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0310 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  36.27 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.53 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.67 
 
 		 397 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.11 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.53 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.56 
 
 		 396 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  34.44 
 
 		 406 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.29 
 
 		 422 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.37 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.72 
 
 		 404 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  37.29 
 
 		 395 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  36.05 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  34.55 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.11 
 
 		 391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  31.36 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32.88 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 		 387 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 		 405 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.18 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.31 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.2 
 
 		 416 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  27.96 
 
 		 420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 		 388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.96 
 
 		 373 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  33.22 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.67 
 
 		 414 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  33.77 
 
 		 412 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  31.83 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  34.31 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.72 
 
 		 427 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  32.57 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.09 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  31.65 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.45 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.01 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  27.95 
 
 		 424 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.24 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.24 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0771  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  28.91 
 
 		 448 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.01 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.6 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  31.11 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.97 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  27.51 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.21 
 
 		 390 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  27.94 
 
 		 440 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  27.94 
 
 		 440 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  27.94 
 
 		 440 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  27.94 
 
 		 440 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  29.24 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  28.52 
 
 		 417 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.71 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.6 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  27.53 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  34.01 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  31.29 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.25 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.96 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.87 
 
 		 426 aa  109  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.07 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  28.98 
 
 		 506 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  27.99 
 
 		 421 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.35 
 
 		 388 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.54 
 
 		 391 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.99 
 
 		 447 aa  108  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.54 
 
 		 391 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.53 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 383 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  33.22 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  25.87 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.07 
 
 		 378 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  30.19 
 
 		 412 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.71 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  30.6 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  29.91 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.67 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.46 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.74 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.32 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.73 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>