More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2199 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  847    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  70.51 
 
 
417 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  58.33 
 
 
428 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  54.21 
 
 
420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  47.91 
 
 
424 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  45.61 
 
 
421 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  43.96 
 
 
421 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  43.14 
 
 
412 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  43.53 
 
 
417 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  44.61 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  44.61 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  44.61 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  44.61 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  44.33 
 
 
414 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  44.08 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  44.33 
 
 
414 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  44.22 
 
 
421 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  44.47 
 
 
417 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  41.54 
 
 
432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  40.99 
 
 
441 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  42.82 
 
 
417 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  42.62 
 
 
416 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  41.41 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  39.7 
 
 
415 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.26 
 
 
430 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  38.99 
 
 
430 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  41.85 
 
 
402 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  40.48 
 
 
414 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  41.19 
 
 
402 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  37.78 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  37.28 
 
 
430 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  41.25 
 
 
436 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  40.88 
 
 
413 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  38.02 
 
 
438 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.67 
 
 
396 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.78 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.68 
 
 
404 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.49 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.96 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.96 
 
 
404 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.91 
 
 
404 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.43 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.06 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.89 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 
399 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  29.98 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.87 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  34.42 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.9 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 
382 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.3 
 
 
378 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.03 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.43 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.2 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.53 
 
 
309 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.05 
 
 
412 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  30.41 
 
 
379 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.97 
 
 
386 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.29 
 
 
373 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  25.88 
 
 
400 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 
413 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 
387 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 
412 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.54 
 
 
421 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.64 
 
 
404 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.38 
 
 
376 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.89 
 
 
406 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 
374 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.72 
 
 
414 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.82 
 
 
383 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.05 
 
 
402 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 
364 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 
400 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  27.79 
 
 
401 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.95 
 
 
386 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 
382 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 
364 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 
396 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.88 
 
 
360 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 
385 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.71 
 
 
385 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  25.27 
 
 
400 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.99 
 
 
382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.99 
 
 
382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.72 
 
 
388 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 
376 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26.68 
 
 
385 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.74 
 
 
377 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  30.09 
 
 
374 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.07 
 
 
374 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.41 
 
 
385 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 
376 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.67 
 
 
378 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.45 
 
 
376 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.68 
 
 
385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 
399 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>