More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3061 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  855    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  58.33 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  54.36 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  48.9 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  48.87 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  42.21 
 
 		 412 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  44.95 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  42.13 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  40.78 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  40.78 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  40.78 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  41.88 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  40.78 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  42.13 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  43.95 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  43.95 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  41.89 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  41.27 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  39.85 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  42.38 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  42.2 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  42.44 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  37.93 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  37.68 
 
 		 432 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  36.39 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  37.28 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  41.11 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  42.82 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  39.6 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  36 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  38.69 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  38.36 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  35.6 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.34 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.57 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.19 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.77 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.92 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.33 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  31.06 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.81 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.81 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.84 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.61 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.48 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.81 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.9 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.82 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.58 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.56 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.97 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  29.04 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.25 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.73 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.2 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  31.89 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.33 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  28.69 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.17 
 
 		 402 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.59 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.27 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.03 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.42 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  30.17 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.28 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.14 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.28 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.07 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.07 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.12 
 
 		 387 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  24.8 
 
 		 421 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07382  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01460)  27.96 
 
 		 422 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.14 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.43 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.69 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  27.37 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>