More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2238 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  875    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  69.83 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  69.34 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  69.34 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  64.22 
 
 		 441 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  63.24 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  45.81 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  39.72 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  39.27 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  42.56 
 
 		 417 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  40.79 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  41.35 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  39.3 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  39.51 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  37.72 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  37.37 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  40.36 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  39.41 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  39.65 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  38.86 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  38.86 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  38.86 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  39.4 
 
 		 414 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  38.86 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  39.8 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  36.45 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  40.92 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  40.65 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  43.03 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  35.07 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.86 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  38.18 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  37.35 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  34.25 
 
 		 415 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33.72 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.68 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.63 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.29 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.4 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  32.3 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  32.3 
 
 		 364 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  32.02 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.18 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.62 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.15 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.24 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.28 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.03 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.66 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.63 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.02 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.24 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  29.04 
 
 		 697 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.22 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.22 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.88 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.61 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.07 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  30.12 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.66 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.91 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.34 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  23.08 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.2 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.56 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.24 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.29 
 
 		 377 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.33 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.33 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.67 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.49 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.61 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 		 377 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  32.54 
 
 		 397 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  31.14 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.59 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.19 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.19 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  28.7 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.77 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.49 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  29.45 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>