More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3698 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  853    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  70.56 
 
 		 413 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  54.01 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  54.57 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  45.7 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  44.61 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  45.06 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  45.19 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  44.33 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  44.08 
 
 		 414 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  44.08 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  44.08 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  44.08 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  44.08 
 
 		 440 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  44.33 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  44.58 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  42.93 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  42.63 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  42.04 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  41.12 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  43.48 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  43.58 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.9 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  40.5 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  39.45 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  39.24 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  40.57 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  40.65 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  41.94 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  40.38 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  37.22 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  37.94 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  39.29 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.34 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.61 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.32 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.56 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  35.11 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.3 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.79 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.49 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.49 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.02 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.81 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.88 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.96 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.04 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.57 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.3 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.61 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.34 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.74 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  28.02 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  30.55 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.5 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  26.17 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.5 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.54 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.78 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.27 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.18 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.12 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  28.42 
 
 		 697 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  28.29 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.53 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  30.17 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.14 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  26.67 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30.41 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  29.52 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.38 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.92 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.49 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30.14 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>