More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0336 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
412 aa  857    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  48.43 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  48.54 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  47.64 
 
 
421 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  49.61 
 
 
417 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  45.3 
 
 
424 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  42.93 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  43.37 
 
 
417 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  44.7 
 
 
417 aa  335  7.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  42.17 
 
 
413 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  43.35 
 
 
417 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  42.86 
 
 
416 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  42.68 
 
 
415 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  42.21 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  39.15 
 
 
417 aa  308  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  41.02 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  41.89 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  44.25 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  41.63 
 
 
414 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  41.16 
 
 
433 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  41.89 
 
 
414 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  39.5 
 
 
432 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  41.62 
 
 
414 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  41.78 
 
 
440 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  41.78 
 
 
440 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  41.78 
 
 
440 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  41.78 
 
 
440 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  41.73 
 
 
414 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  38.75 
 
 
430 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  37.56 
 
 
430 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  38.73 
 
 
430 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  41.6 
 
 
413 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  41.26 
 
 
402 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  41.69 
 
 
402 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.69 
 
 
399 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.15 
 
 
396 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.79 
 
 
385 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.48 
 
 
403 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.94 
 
 
391 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.64 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.01 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.04 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 
412 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.3 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.82 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.88 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.62 
 
 
364 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.35 
 
 
364 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  30.35 
 
 
360 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
400 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.27 
 
 
404 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.73 
 
 
404 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 
399 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
376 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.94 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.41 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.29 
 
 
400 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.8 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.56 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  32.11 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  31.53 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.7 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.45 
 
 
387 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  34.05 
 
 
395 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.36 
 
 
404 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  27.47 
 
 
413 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.27 
 
 
404 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.34 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25.71 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.14 
 
 
397 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 
385 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  29.81 
 
 
381 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.37 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.23 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  30.17 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  29.35 
 
 
697 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.07 
 
 
379 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 
397 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 
397 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 
397 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.77 
 
 
397 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25.14 
 
 
378 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
399 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 
405 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 
412 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.65 
 
 
377 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.91 
 
 
374 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  28.49 
 
 
397 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 
382 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 
385 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 
382 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.79 
 
 
374 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  28.99 
 
 
402 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
397 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>