More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3637 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  829    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  90.17 
 
 		 417 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  60.25 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  58.44 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  55.39 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  49.27 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  46.72 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  48.94 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  42.86 
 
 		 412 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  45.91 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  46.12 
 
 		 421 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  49.49 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  41.88 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  46.32 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  46.34 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  42.29 
 
 		 413 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  42.96 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  42.3 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  40.61 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  41.82 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  42.03 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  41.77 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  40.98 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  41.52 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  41.52 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  41.52 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  41.52 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  41.77 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  38.61 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  45.5 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  38.04 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  37.44 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  36.32 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  39.04 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  36.34 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.71 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  35.46 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.44 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.15 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.19 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  33.15 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.04 
 
 		 397 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  32.35 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.15 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30 
 
 		 403 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  32.51 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  36.32 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.18 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.82 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.87 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.17 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.42 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.41 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.12 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.21 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.98 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.42 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.91 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.97 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.52 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  27.42 
 
 		 697 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.05 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  33.15 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.83 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.88 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.88 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.61 
 
 		 379 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.87 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  29.74 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.97 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  28.8 
 
 		 309 aa  97.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  26.74 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.26 
 
 		 385 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  26.74 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  26.74 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.56 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  33.73 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>