More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4355 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  840    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  47 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  45.05 
 
 
421 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  48.22 
 
 
417 aa  349  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  45.1 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  48.91 
 
 
402 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  49.18 
 
 
402 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  42.69 
 
 
412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  47.73 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  44.61 
 
 
415 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  43.03 
 
 
413 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  43.84 
 
 
417 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  46.49 
 
 
417 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  45.89 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  43.75 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  45.89 
 
 
416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  41.58 
 
 
424 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  45.11 
 
 
414 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  42.13 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  41.22 
 
 
438 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  41.75 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  39.7 
 
 
432 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  41.44 
 
 
428 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.36 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  40.75 
 
 
417 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  41.5 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  41.75 
 
 
414 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  39.19 
 
 
430 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  40.5 
 
 
430 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  38.85 
 
 
433 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.73 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.83 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.95 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  36.18 
 
 
400 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.68 
 
 
397 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 
395 aa  126  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.54 
 
 
385 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
399 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.17 
 
 
400 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  34.66 
 
 
395 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.87 
 
 
398 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.67 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.46 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.36 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.61 
 
 
421 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  31.3 
 
 
406 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  32.63 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.75 
 
 
422 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.37 
 
 
404 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.92 
 
 
413 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.48 
 
 
404 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  26.96 
 
 
401 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  28.78 
 
 
401 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.73 
 
 
395 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  29.62 
 
 
408 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.98 
 
 
364 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  28.33 
 
 
401 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.51 
 
 
397 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.97 
 
 
427 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.98 
 
 
364 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.39 
 
 
430 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.72 
 
 
360 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 
396 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 
397 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.32 
 
 
414 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  31.64 
 
 
395 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
382 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.13 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.33 
 
 
385 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.9 
 
 
404 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.4 
 
 
412 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.33 
 
 
385 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.33 
 
 
385 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.4 
 
 
388 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.71 
 
 
377 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.34 
 
 
399 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
425 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  29.33 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.14 
 
 
397 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.14 
 
 
397 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.12 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.14 
 
 
397 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 
382 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  28.14 
 
 
397 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 
373 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 
406 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.26 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  27.87 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
383 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>