More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5376 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  47.44 
 
 		 417 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  41.02 
 
 		 412 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  41.94 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  42.15 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  41.35 
 
 		 421 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  45.79 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  40.9 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  43.85 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  39.7 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  42.79 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  42.3 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  37.76 
 
 		 417 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  42.82 
 
 		 402 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  42.54 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  40.05 
 
 		 415 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  38.06 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  38.2 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  38.44 
 
 		 441 aa  246  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  37.78 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  39.17 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  37.5 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  36.34 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  34.54 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  37.34 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  38.31 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  38.06 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  38.54 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  38.69 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  38.69 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  38.69 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  38.69 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  35.7 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  36.12 
 
 		 413 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  34.29 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33.61 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.86 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  32.03 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.65 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.54 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.87 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.57 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.94 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.75 
 
 		 421 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  31.95 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.1 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30.22 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.92 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.21 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.29 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.52 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.29 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  29.83 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.12 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.11 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.73 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.13 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.69 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.87 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.35 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.95 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  35.12 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  31.7 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.3 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 		 383 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  28.45 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.08 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.04 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.68 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 385 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.35 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.45 
 
 		 364 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.57 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.65 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  30.97 
 
 		 382 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.77 
 
 		 360 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  25.91 
 
 		 372 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.27 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>