More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1945 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  88.97 
 
 		 430 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  868    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  77.86 
 
 		 432 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  69.34 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  65.96 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  67.4 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  48.28 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  43.65 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  45.1 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  39.9 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  41.4 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  39.81 
 
 		 421 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  39.76 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  39.41 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  39.8 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  39.26 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  42.53 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  42.54 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  37.93 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  39.52 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  40.16 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  35.73 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  39.62 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  37.72 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  37.72 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  37.72 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  37.72 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  38.07 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  37.82 
 
 		 414 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 414 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  38.04 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  37.9 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  36.78 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  38.33 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.94 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.48 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.61 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.06 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.9 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.74 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.2 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.11 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  28.41 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  29.58 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.08 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.89 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.74 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  29.04 
 
 		 309 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.91 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.8 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  31.59 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.65 
 
 		 386 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.39 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  27.47 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.13 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  28.73 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.54 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.01 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.33 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  28.75 
 
 		 381 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.02 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.53 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.33 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.09 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  27.99 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  30.97 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.31 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  27.68 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.87 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  27.72 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26.51 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.31 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>