More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2684 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  851    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  60.24 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  61.27 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  60.93 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  56.51 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  45.24 
 
 		 421 aa  349  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  46.17 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  47.83 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  43.61 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  45.97 
 
 		 421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  45.72 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  45.38 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  39.46 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  39.7 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  40.4 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  46.81 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  39.45 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  43.41 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  37.28 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  36.87 
 
 		 417 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  42.86 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  41.27 
 
 		 414 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  41.27 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  41.01 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  41.01 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  41.01 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  41.01 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  41.01 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  40.16 
 
 		 438 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  36.78 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  35.26 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  37.08 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  34.01 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  35.88 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.76 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.25 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.82 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  34.92 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 		 399 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.28 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.93 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  29.07 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.37 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.09 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.5 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.28 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.5 
 
 		 364 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.58 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.31 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  31.83 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.46 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.48 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.62 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.87 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.18 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  28.37 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.65 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  30.03 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.84 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  30.6 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.85 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  29.28 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  29.28 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.28 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  29.28 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.85 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.51 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  30 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.52 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.7 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.14 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  29.01 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  30.85 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  29.52 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.65 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.88 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  29.89 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.88 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  29.89 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.78 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.17 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>