More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3441 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  845    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  48.93 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  48.79 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  48.42 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  45.81 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  50.49 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  48.4 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  47.13 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  46.8 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  45.28 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  46.63 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  45.8 
 
 		 420 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  41.44 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  41.49 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  41.4 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  41.16 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  44.75 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  41.54 
 
 		 413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  38.19 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  40.15 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  41.71 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.76 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  41.16 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  40.88 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  36.82 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  39.04 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  38.93 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  38.93 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  38.93 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  38.93 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  38.93 
 
 		 414 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  42.9 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  38.68 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  38.93 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.49 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  29.63 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.85 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.42 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.24 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.09 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.33 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.23 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.9 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.62 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  28.97 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.1 
 
 		 378 aa  104  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  26.54 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.95 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.97 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.36 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.52 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.12 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.03 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.11 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  27.18 
 
 		 697 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.33 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  28.32 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.17 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.32 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.34 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  26.36 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  24.86 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  29.23 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.79 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.21 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  26.48 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  23.37 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.07 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.09 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.57 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.41 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.9 
 
 		 374 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  27.02 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  27.32 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.4 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  27.27 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  28.99 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.59 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.44 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.23 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>