More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6172 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  837    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  52.29 
 
 
421 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  50.49 
 
 
412 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  52.94 
 
 
421 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  50.48 
 
 
420 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  49.29 
 
 
421 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  47.47 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  47.74 
 
 
417 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  46.35 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  49.01 
 
 
417 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  45.85 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  47.59 
 
 
438 aa  335  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  50 
 
 
416 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  48.02 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  46.75 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  44.59 
 
 
424 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  47.66 
 
 
402 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  45.34 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  47.66 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  45.27 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  49.35 
 
 
436 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  47.62 
 
 
413 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  43.94 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  43.8 
 
 
428 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  47.16 
 
 
414 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  42.57 
 
 
430 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  43.83 
 
 
440 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  43.83 
 
 
440 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  44.08 
 
 
414 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  43.83 
 
 
440 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  43.83 
 
 
440 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  43.83 
 
 
414 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  42.86 
 
 
417 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  44.08 
 
 
414 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  33.98 
 
 
397 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  33.42 
 
 
396 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.06 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  32.13 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  33.99 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.25 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 
404 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
406 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.81 
 
 
403 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.24 
 
 
385 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.99 
 
 
400 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  31.09 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.58 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.79 
 
 
422 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  34.85 
 
 
400 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  36.12 
 
 
395 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.71 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  32.19 
 
 
399 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.24 
 
 
377 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  32.79 
 
 
404 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  34.74 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.62 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  31.63 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
376 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 
388 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.49 
 
 
402 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
405 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.94 
 
 
388 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.45 
 
 
384 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 
373 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
364 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.42 
 
 
404 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
395 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 
395 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.15 
 
 
407 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.93 
 
 
364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.39 
 
 
414 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  30.73 
 
 
360 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
381 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  27 
 
 
377 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.41 
 
 
397 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.71 
 
 
377 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 
373 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  33.53 
 
 
378 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  31.29 
 
 
376 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.9 
 
 
386 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.39 
 
 
395 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.36 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.49 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  29.48 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.49 
 
 
389 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.24 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  32.33 
 
 
412 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  29.92 
 
 
427 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.86 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>