More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09400 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  98.26 
 
 
402 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  62.03 
 
 
413 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  49.18 
 
 
421 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  45.58 
 
 
420 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  46.92 
 
 
417 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  44.39 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  44.66 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  45.8 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  40.68 
 
 
412 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  43.87 
 
 
417 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  46.34 
 
 
416 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  46.07 
 
 
417 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  43.13 
 
 
441 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  46.54 
 
 
414 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  42.31 
 
 
440 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  42.31 
 
 
440 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  42.58 
 
 
414 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  42.31 
 
 
440 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  42.31 
 
 
440 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  42.31 
 
 
414 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  42.58 
 
 
414 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  38.35 
 
 
424 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  41.29 
 
 
413 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  40.99 
 
 
417 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  40.29 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  43.03 
 
 
433 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  40.34 
 
 
432 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  42.25 
 
 
415 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.33 
 
 
430 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  42.82 
 
 
438 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  37.92 
 
 
428 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  39.27 
 
 
430 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  38.29 
 
 
430 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.79 
 
 
391 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.78 
 
 
400 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.71 
 
 
396 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.61 
 
 
397 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.07 
 
 
399 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  33.52 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.58 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.93 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  33.6 
 
 
398 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  33.69 
 
 
395 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  27.87 
 
 
697 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 
387 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  29.19 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.22 
 
 
421 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  30.2 
 
 
400 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.22 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  31.17 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 
397 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
392 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.57 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.22 
 
 
402 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 
381 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.87 
 
 
422 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.38 
 
 
404 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  30.36 
 
 
397 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  30.08 
 
 
397 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 
413 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.55 
 
 
400 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.6 
 
 
404 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 
383 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.34 
 
 
412 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  31.43 
 
 
402 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  31.14 
 
 
402 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  30.06 
 
 
402 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 
376 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
395 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.13 
 
 
390 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 
430 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.79 
 
 
376 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
382 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  28.41 
 
 
377 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  30.48 
 
 
404 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.07 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 
397 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  29.51 
 
 
402 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  30.25 
 
 
427 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.45 
 
 
384 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.61 
 
 
414 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 
373 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.69 
 
 
377 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  31.85 
 
 
404 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.2 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.2 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>