More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2927 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  872    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  55.21 
 
 
420 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  47.09 
 
 
413 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  48.74 
 
 
428 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  44.73 
 
 
417 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  45.3 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  44.44 
 
 
440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  44.44 
 
 
440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  44.44 
 
 
440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  44.44 
 
 
440 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  44.7 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  44.44 
 
 
414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  44.19 
 
 
414 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  44.59 
 
 
417 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  41.79 
 
 
421 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  42 
 
 
421 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  41.04 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  40.2 
 
 
417 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  41.88 
 
 
417 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  42.3 
 
 
416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  40.33 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  42.71 
 
 
436 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  39.36 
 
 
415 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  38.52 
 
 
441 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  38.81 
 
 
432 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  37.91 
 
 
402 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  38.36 
 
 
402 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  37.08 
 
 
414 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  39.17 
 
 
413 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  35.73 
 
 
430 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  35.11 
 
 
430 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  36.83 
 
 
433 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  35.11 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  34.54 
 
 
438 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.99 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.45 
 
 
396 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.58 
 
 
403 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.27 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.79 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.37 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.98 
 
 
399 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.51 
 
 
402 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.07 
 
 
406 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
412 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.65 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
376 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.42 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.14 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 
400 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.54 
 
 
309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  28.8 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  27.62 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 
377 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  29.05 
 
 
697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  27.61 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.48 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.16 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.29 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.33 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.01 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 
410 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  28.69 
 
 
402 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  27.61 
 
 
382 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 
430 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  29.01 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  29.72 
 
 
427 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  28.94 
 
 
404 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 
404 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25.65 
 
 
383 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.56 
 
 
389 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.45 
 
 
364 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 
404 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  29.12 
 
 
397 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.78 
 
 
378 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  26.39 
 
 
373 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.95 
 
 
360 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 
364 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 
382 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.76 
 
 
421 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.57 
 
 
404 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.29 
 
 
402 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.86 
 
 
407 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
397 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
397 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  28.37 
 
 
402 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 
402 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
397 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  28.25 
 
 
402 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  28.85 
 
 
397 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.71 
 
 
386 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.37 
 
 
377 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  27.7 
 
 
403 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  29.41 
 
 
404 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>