More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4386 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  67.39 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  66.67 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  65.61 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  63.39 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  65.85 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  48.28 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  45.43 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  44.94 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  43.75 
 
 		 421 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  41.89 
 
 		 412 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  41.19 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  40.1 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  40.73 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  40.99 
 
 		 413 aa  282  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  42.21 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  45 
 
 		 413 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  43.13 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  42.01 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  38.81 
 
 		 424 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  40.82 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  43.13 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  39.45 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  39.51 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  38.94 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  40.83 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  38.69 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  36.39 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  38.89 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  38.89 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  38.89 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  38.94 
 
 		 414 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.59 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  32.39 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.4 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.36 
 
 		 391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.17 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.44 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.04 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.92 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.92 
 
 		 364 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  30.64 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.84 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.78 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  30.64 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.08 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  31.2 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.84 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  30.92 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  29.66 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  29.74 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  31.45 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.4 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  30.61 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  28.19 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.72 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  28.6 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.13 
 
 		 386 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.33 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.97 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.65 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.08 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.05 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.63 
 
 		 373 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 		 401 aa  93.2  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.43 
 
 		 378 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  25.95 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  29.73 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.78 
 
 		 388 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.3 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.72 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.73 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 		 421 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.71 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  28.6 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>