More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0321 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  812    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  55.92 
 
 
417 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  56.2 
 
 
415 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  54.13 
 
 
417 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  55.17 
 
 
416 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  48.29 
 
 
420 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  45.5 
 
 
421 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  48.25 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  45.39 
 
 
421 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  44.61 
 
 
421 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  42.61 
 
 
412 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  46.58 
 
 
417 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  46.26 
 
 
402 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  46.54 
 
 
402 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  45.89 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  43.64 
 
 
414 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  43.64 
 
 
414 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  43.39 
 
 
414 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  43.39 
 
 
440 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  43.39 
 
 
440 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  43.39 
 
 
440 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  43.39 
 
 
440 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  41.75 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  39.71 
 
 
413 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  41.69 
 
 
441 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  46.98 
 
 
413 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  40.15 
 
 
417 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  39.65 
 
 
432 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.15 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  38.82 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  37.08 
 
 
424 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  38.04 
 
 
417 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  38.19 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  40.3 
 
 
433 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  31.99 
 
 
396 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.82 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.49 
 
 
391 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.72 
 
 
377 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.88 
 
 
406 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.22 
 
 
397 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.88 
 
 
404 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.76 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.24 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.25 
 
 
421 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
412 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.27 
 
 
364 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  28.61 
 
 
403 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 
376 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.27 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.62 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.52 
 
 
378 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
395 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.89 
 
 
414 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30.31 
 
 
397 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.76 
 
 
373 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.34 
 
 
386 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.4 
 
 
374 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 
401 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 
362 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.52 
 
 
402 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.4 
 
 
382 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 
404 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 
395 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  30.13 
 
 
427 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.95 
 
 
395 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  30.35 
 
 
385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 
395 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.41 
 
 
392 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
378 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.84 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 
376 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.15 
 
 
384 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.62 
 
 
385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.62 
 
 
385 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 
410 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 
385 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.58 
 
 
400 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.87 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  31.96 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
395 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.71 
 
 
379 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  30.06 
 
 
399 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.44 
 
 
388 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.09 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.58 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  26.68 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 
362 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.68 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  32.87 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.52 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>