More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1206 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  90.37 
 
 		 416 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  61.11 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  59.5 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  54.13 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  49.15 
 
 		 420 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  47.43 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  47.49 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  46.49 
 
 		 421 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  43.35 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  47.61 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  48.49 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  40.05 
 
 		 424 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  42.61 
 
 		 413 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  46.58 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  46.32 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  42.2 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  42.46 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  39.69 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  42.34 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  40.76 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  40.51 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  40.25 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  40.25 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  40.25 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  40.25 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  40.51 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  46.32 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  39.6 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  37.69 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  36.9 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  37.4 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  36.41 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.56 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.98 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.44 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  31.34 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.15 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.01 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  32.35 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  32.35 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  32.08 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.91 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  30.11 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  32.56 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.46 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  31.68 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  34.77 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.22 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.85 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  31.37 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.9 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  31.87 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.01 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.39 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.87 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.27 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.56 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  31.18 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.21 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.26 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.83 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.17 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.05 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  31.49 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  29.27 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.26 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.5 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.06 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.18 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.36 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  26.82 
 
 		 697 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.12 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  29.01 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  30.05 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.49 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  27.62 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  27.62 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  25.64 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  27.62 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  27.62 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.25 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  30.34 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>