More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1561 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  37 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  35.01 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  36.41 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  39.42 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  36.49 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  33.7 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  38.55 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  37.43 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  35.69 
 
 		 374 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  35 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  34.38 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  35.69 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  31.64 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  32.71 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  33.62 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  33.16 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  31.91 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  31.61 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  32.74 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  31.61 
 
 		 429 aa  125  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.58 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.49 
 
 		 397 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.2 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.58 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  30.37 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.03 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  34.55 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  32.92 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.51 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.7 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.9 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.26 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  29.38 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  31.51 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.04 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.83 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.23 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  28.43 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  28.43 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  32.6 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  31.9 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  28.42 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  32.42 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.94 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  27.61 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  31.31 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  29.57 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.07 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.86 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  33.23 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.14 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  27.09 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  28.06 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  29.26 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.46 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.53 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  32.71 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  32.71 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 		 382 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  28.13 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  29.23 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.98 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.18 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.89 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.65 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  28.09 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.18 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.16 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 		 388 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  26.9 
 
 		 697 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.5 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.41 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.42 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  28.32 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.3 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>