More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1535 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 422 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  43.42 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  35.67 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  44.81 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3466  monooxygenase, FAD-binding  36.52 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0545  oxidoreductase protein  35.38 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0440  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0943043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0427  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  hitchhiker  0.0000412039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  33.43 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  31.04 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  23.81 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.78 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.63 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.56 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.97 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.53 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.74 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  30.41 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  31.74 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  30.26 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  29.82 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.39 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  29.8 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.05 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.51 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  27.75 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  29.15 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.96 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  28.86 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  28.86 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  28.86 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.31 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  28.86 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  28.86 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.66 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.78 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.33 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.73 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.63 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  26.41 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3529  kynurenine 3-monooxygenase  28.29 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.978115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.87 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.72 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.87 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  23.14 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9233  Monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  28.38 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  26.59 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  24.92 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.3 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  29.48 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  28.35 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.86 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.04 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  25.5 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  29.46 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  25.43 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.53 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.87 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  27.5 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  27.5 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.57 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  27.38 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3904  kynurenine 3-monooxygenase  27.65 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  27.58 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  28.03 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  27.52 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  27.75 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  28.43 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.37 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  29.07 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  29.47 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  27.12 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.3 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  25.95 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  25.95 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.35 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  25.95 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  28.01 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  30.38 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  25.66 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.11 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  23.68 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>