More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1936 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  60.37 
 
 		 376 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  52.82 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  54.96 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  53.49 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  46.95 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  41.87 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  40.91 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  37.26 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  39.26 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  38.24 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  36.12 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  36.09 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  34.38 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  35.36 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  31.75 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  31.95 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.81 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.81 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  32.8 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.57 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.3 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.92 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.61 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.43 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.7 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  27.73 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.7 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.7 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.42 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  25.84 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  30.53 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.78 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  29.71 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.43 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  29.85 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  27.66 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.17 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  26.14 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  26.5 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  25.96 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  25.96 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.51 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  26.35 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  37.17 
 
 		 123 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  23.19 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  27.51 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.98 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  27.51 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  25.96 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.04 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00530  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 435 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.192511  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.92 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.14 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.07 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  30.72 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.76 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  23.63 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2455  putative monooxygenase (putative secreted protein)  32.63 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  28.2 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  24.75 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  27.57 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  24.3 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  24.15 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  24.55 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  31.01 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  25.42 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.09 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  28.39 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  27.35 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.88 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.9 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.13 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.48 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.75 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  29.45 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  26.54 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  27.36 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  26.89 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  24.14 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  25.32 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  24.94 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  23.97 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  24.94 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>