More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0928 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
424 aa  858    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  49.87 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  45.43 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  47.09 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  44.96 
 
 
387 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  42.29 
 
 
399 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  43.9 
 
 
400 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  41.9 
 
 
400 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  45.66 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  40.16 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  43.27 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  42.23 
 
 
393 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  40.75 
 
 
404 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.23 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  42.62 
 
 
424 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  38.23 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42.78 
 
 
398 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  37.72 
 
 
400 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  37.88 
 
 
400 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  37.88 
 
 
400 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  38.59 
 
 
377 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  41.21 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  41.89 
 
 
396 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  39.73 
 
 
400 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  38.74 
 
 
398 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  38.38 
 
 
467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  38.39 
 
 
370 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  37.44 
 
 
403 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  38.16 
 
 
391 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  36.77 
 
 
415 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 
372 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  35.44 
 
 
380 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  39.89 
 
 
408 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.38 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  38.48 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
371 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  36.64 
 
 
388 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  34.11 
 
 
384 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  36.18 
 
 
415 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.88 
 
 
390 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.78 
 
 
423 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 
388 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  38.46 
 
 
351 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.91 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.35 
 
 
396 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.51 
 
 
418 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  35.34 
 
 
381 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.91 
 
 
434 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
413 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.17 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  29.52 
 
 
396 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  28.32 
 
 
405 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  32.3 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.31 
 
 
377 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.51 
 
 
368 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.2 
 
 
368 aa  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.41 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.57 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.46 
 
 
399 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  28.21 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  27.93 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.65 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  28.21 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  28.09 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  28.09 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  28.09 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  28.09 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.96 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.93 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.07 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  30.91 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  27.13 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.09 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.61 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  28.05 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  29.06 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  28.82 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.61 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.49 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  32.4 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9233  Monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.61 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  30.33 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.48 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.5 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.85 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>