More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9233 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9233  Monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
376 aa  772    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
402 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.99 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.27 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  27.56 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3437  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.29 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.73 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  24.46 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.67 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  26.72 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.95 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.29 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  25.75 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.09 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  25.43 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.97 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  24.66 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.15 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  24.6 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  24.6 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  26.08 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  23.81 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  24.86 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1010  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.08 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  normal  0.0569415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  24.72 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  24.33 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  25.85 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1006  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.51 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152891  normal  0.26628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1071  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.8 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719385  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  23.61 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  24.43 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25.44 
 
 
362 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  21.98 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  25.59 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  25.51 
 
 
697 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  26.91 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  26.79 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 
473 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.75 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  25.22 
 
 
489 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  23.8 
 
 
530 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  23.54 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  25.53 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  24.23 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  26.01 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.07 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.47 
 
 
510 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  24.48 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  21.33 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  23.29 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  24.42 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  23.6 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  24.15 
 
 
506 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27608  predicted protein  28.69 
 
 
971 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000591044  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  21.33 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  25.43 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  24.18 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  27.16 
 
 
515 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.64 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  25.97 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  24.24 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  27.3 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  21.05 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  25.7 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.53 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.35 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.35 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  22.95 
 
 
500 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  23.98 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2921  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.46 
 
 
397 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000284192  normal  0.0970555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.45 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  23.28 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.45 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  25.09 
 
 
710 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  23.95 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  26.21 
 
 
392 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  26.51 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  25.67 
 
 
489 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  25.29 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1183  oxidoreductase, FAD-binding  24.05 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0020  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.64 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.847468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>