More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4138 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 
408 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  94.12 
 
 
408 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  68.55 
 
 
408 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  53.16 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  52.24 
 
 
399 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  53.28 
 
 
399 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  44.14 
 
 
392 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  43.15 
 
 
393 aa  292  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  45.64 
 
 
423 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  38.37 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  39.11 
 
 
392 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  37.04 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  38.24 
 
 
401 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  37.46 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  26.97 
 
 
377 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.84 
 
 
421 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 
384 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 
395 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 
382 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 
385 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  25.51 
 
 
377 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 
419 aa  103  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.66 
 
 
377 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.65 
 
 
397 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.69 
 
 
377 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.84 
 
 
378 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.98 
 
 
388 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.27 
 
 
386 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  27.82 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  30.81 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.4 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.26 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.26 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  29.68 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.13 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  28.65 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.65 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.13 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  28.65 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  32.63 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.33 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.33 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.96 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.61 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  29.53 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.9 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 
378 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.92 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.43 
 
 
386 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.88 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  25.86 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.83 
 
 
364 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  28.44 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.23 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.81 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.07 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.3 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  24.47 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.41 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  29.48 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.02 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.1 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.35 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.86 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.31 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  25.76 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.28 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  25.76 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.38 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  26.86 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  29.71 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3464  hypothetical protein  26.07 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  27.05 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  28.49 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.28 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.9 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>